最高额抵押合同变更制度，是指被担保债权、最高限额、决算期等的变更，最高额抵押合同作为当事人双方意思自治的担保，当然可以按双方的意思对合同条款进行变更，但是最高额抵押合同是涉及物权变动的合同，其条款的变更，除涉及双方当事人的利益外，还会涉及第三人的利益，因此《物权法》第205条对最高额抵押合同条款的变更作了一些限制性规定，金融机构在实际操作过程中应加以注意：

1、抵押权人与抵押协议变更债权确定的期间、债权范围以及最高债权额的，须在最高额抵押担保的债权确定之前，这是最高额抵押协议变更在时间上的限制。否则，如已届决算期的，应按《物权法》第203条第2款的规定，重新设立最高额抵押权，并在担保人协商一致后将已经存在的债权，转入最高额抵押担保的债权范围。

2、变更的内容不得对其他抵押权人产生不利影响。如果，当事人变更的内容对其他抵押权人产生不利影响，则不得以其变更对抗顺序在后的抵押权人。

3、依据抵押财产的性质，非经登记不生效或者非经登记不得对抗善意第三人，因此变更最高额抵押合同内容时，须办理相应的登记。